فایل سل

فایل سل1

فایل سل

فایل سل1

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
آموزش lammps , شبیه سازی مولکول DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی DNA با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۱۶ فروردین ۱۳۹۵

(آموزش lammps) در این آموزش مولکول DNA را به روش دینامیک مولکولی در داخل آب و یون شبیه سازی کردیم. در مورد مولکول دی ان آ توضیحاتی داده ایم. نحوه تولید دیتا فایل و فایل ورودی گام به گام توضیح داده شده است. در آخر سر از برنامه اجرا گرفته و با استفاده از VMD آن را نمایش داده ایم. میدان نیرو چارم (Force Field CHARMM) در این شبیه سازی استفاده  شده است. مدل آب نیز TIP3P می باشد. طول فیلم ۵۰ دقیقه ...

آموزش lammps


DNA


شبیه سازی


دینامیک مولکولی


سیستم زیستی


LAMMPS


میدان نیرو


force field charmm

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی نانولوله کربنی (Carbon Nanotube) با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی نانولوله کربنی (Carbon Nanotube) با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
آموزش lammps. شبیه سازی یک نانولوله کربنی با نرم افزار لمپس (lammps) با پتانسیل ترسوف
(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی نانولوله کربنی (Carbon Nanotube) با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۱۵ فروردین ۱۳۹۵

(آموزش lammps) در این شبیه سازی یک نانولوله کربنی با استفاده از نرم افزار vmd ساخته می شود و از روی آن دیتا فایل ایجاد می گردد. پتانسیل مورد نظر برای مدل کردن بر هم کنش بین اتمهای کربن ترسوف (Tersoff) می باشد. طول فیم ۲۱ دقیقه و به فرمت mp4 است. کیفیت فیلم HD است.این آموزش توی لینوکس ابونتو تهیه شده و قابل انجام است.  تاریخ انتشار ۱۵ فروردین ۱۳۹۵ ...

آموزش lammps


نانولوله کربنی


شبیه سازی نانوتیوب


دینامیک مولکولی


carbon nanotube


ترسوف


tersoff

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی غشای سلولی با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی غشای سلولی با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
آموزش lammps. در این آموزش سعی شده است به روش ساده و گام به گام غشای سلولی را به روش دینامیک مولکولی شبیه سازی کرده و آن را اجرا کنیم
(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی غشای سلولی با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی
(آموزش lammps) در این آموزش سعی شده است به روش ساده و گام به گام غشای سلولی را به روش دینامیک مولکولی شبیه سازی کرده و آن را اجرا کنیم. نرم افزار مورد استفاده لمپس (LAMMPS) می باشد. فایلهای مورد نیاز همراه آموزش قرار داده شده اند. طول فیلم ۱۶ دقیقه و حجم آم ۱۴۰ مگابایت و به فرمت mp4 است. آموزش در محیط لینوکس ubuntu می باشد. تاریخ انتشار ۱۴ فروردین ۱۳۹۵ ...

آموزش lammps


آموزش شبیه سازی


غشای سلولی


membrane


دینامیک مولکولی


لیپید


lipid

(آشنایی با لمپس) - آموزش پکمول (Packmol) برای ایجاد پیکربندی اولیه برای شبیه سازی دینامیک مولکولی

(آشنایی با لمپس) - آموزش پکمول (Packmol) برای ایجاد پیکربندی اولیه برای شبیه سازی دینامیک مولکولی
آموزش تصویری کار با پکمول (Packmol) جهت ایجاد پیکربندی اولیه برای شبیه سازی دینامیک مولکولی
(آشنایی با لمپس) - آموزش پکمول (Packmol) برای ایجاد پیکربندی اولیه برای شبیه سازی دینامیک مولکولی
برای ایجاد پیکربندی اولیه در شبیه سازی مولکولی نیاز به نرم افزار پکمول (Packmol) دارید. این نرم افزار مولکولهای شما را به تعداد دلخواه و با چگالی معین در جعبه شبیه سازی شما قرار می دهد. این آموزش در محیط لینوکس ubuntu بوده و مدت آن ۲۱ دقیقه و حجم آن ۷۲ مگابایت است. فرمت فایل mp4 می باشد. تاریخ انتشار: ۶ فروردین ۱۳۹۵ ...

آموزش تصویری پکمول


Packmol


ایجاد پیکربندی اولیه


شبیه سازی دینامیک مولکولی


LAMMPS


دینامیک مولکولی

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی نانوسیال حاوی نانولوله کربنی و آب با پتانسیل ترکیبی Hybrid به کمک لمپس LAMMPS

(آشنایی با لمپس) شبیه سازی نانوسیال حاوی نانولوله کربنی و آب با پتانسیل ترکیبی Hybrid به کمک لمپس LAMMPS
(آشنایی با LAMMPS) در این آموزش یک نانولوله کربنی در داخل آب با مدل TIP3P قرار گرفته است و این سیستم به کمک نرم افزار لمپس شبیه سازی شده است. نحوه شبی
(آشنایی با لمپس) شبیه سازی نانوسیال حاوی نانولوله کربنی و آب با پتانسیل ترکیبی Hybrid به کمک لمپس LAMMPS
(آشنایی با LAMMPS) در این آموزش یک نانولوله کربنی در داخل آب با مدل TIP3P قرار گرفته است و این سیستم به کمک نرم افزار لمپس شبیه سازی شده است. نحوه شبیه سازی گام به گام گفته شده است. در این شبیه سازی از پتانسیل ترکیبی Hybrid استفاده شده است. زمان آموزش ۱ ساعت بوده و تمامی فایلها نیز همراه آموزش تقدیم خواهد شد. این شبیه سازی در سیستم عامل لینوکس ubuntu انجام شده است. ...

لمپس


نانوسیال نانولوله کربنی و آب


دینامیک مولکولی


pair style hybrid

(آشنایی با لمپس) - نصب VMD جهت نمایش نتایج شبیه سازی دینامیک مولکولی

(آشنایی با لمپس) - نصب VMD جهت نمایش نتایج شبیه سازی دینامیک مولکولی
در این آموزش نحوه دانلود و نصب نرم افزار VMD روی سیستم عامل لینوکس ubuntu به زبان ساده توضیح داده می شود. آموزش به زبان فارسی است.
(آشنایی با لمپس) - نصب VMD جهت نمایش نتایج شبیه سازی دینامیک مولکولی در این آموزش نحوه دانلود و نصب نرم افزار VMD روی سیستم عامل لینوکس ubuntu به زبان ساده توضیح داده می شود. آموزش به زبان فارسی است.
فایل ویدیویی 14 مگابایت حجم دارد و مدت زمان آموزش نیز در حدود 4 دقیقه می باشد. همچنین فرمت ویدیو mp4 است.
تاریخ انتشار: ۵ فروردین 1395

در این آموزش نحوه دانلود و نصب نرم افزار VMD روی سیستم عامل لینوکس ubuntu به زبان ساده توضیح داده می شود. آموزش به زبان فارسی است. فایل ویدیویی 14 مگابایت حجم دارد و مدت زمان آموزش نیز در حدود 4 دقیقه می باشد. همچنین فرمت ویدیو mp4 است. تاریخ انتشار: ۵ فروردین 1395 ...

نصب vmd در ubuntu


دینامیک مولکولی


لمپس


lammps


نرم افزار vmd

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی گرافن (Graphene) با نرم افزار لمپس (LAMMPS) و محاسبه ضریب هدایت گرمایی (Thermal Conductivity) آن

(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی گرافن (Graphene) با نرم افزار لمپس (LAMMPS) و محاسبه ضریب هدایت گرمایی (Thermal Conductivity) آن
آموزش lammps, در این آموزش شبیه سازی گرافن (graphene) را با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی مشاهده خواهید کرد. در ادامه به محاسبه هدایت گر
(آشنایی با لمپس) - شبیه سازی گرافن (Graphene) با نرم افزار لمپس (LAMMPS) و محاسبه ضریب هدایت گرمایی (Thermal Conductivity) آن
(آموزش lammps) در این آموزش  شبیه سازی گرافن (graphene) را با نرم افزار لمپس (LAMMPS) به روش دینامیک مولکولی غیر تعادلی (nonequilibrium molecular dynamics) مشاهده خواهید کرد. در ادامه به محاسبه هدایت گرمایی (thermal conductivity)  خواهیم پرداخت. این آموزش گام به گام بوده به نحوی که شما قادر خواهید بود هدایت گرمایی (thermal conductivity) را حساب کنید. تمامی فایل ها همراه آموزش داده م ...

آموزش lammps


شبیه سازی گرافن


Graphene


نرم افزار لمپس (LAMMPS)


محاسبه ضریب هدایت گرمایی


دینامیک مولکولی


molecular dynamics


thermal conductivity